（1）嚴格禁止使用化學合成的肥料（如尿素、二胺、過磷酸鈣、磷酸二氫鉀等等）。
（2）有機農業(yè)土壤培肥過程中使用的投入物質應滿足國家有機產(chǎn)品標準部分GB/T19630.1-2005附錄A中的要求。
（1）有機農業(yè)土壤培肥物質的來源主要有：a. 農場自制并腐熟的堆肥或漚肥；b.經(jīng)認證機構許可后從農場外購買的農家肥；c. 通過有機認證或經(jīng)認證機構許可的有機商品肥。但有機農業(yè)倡導盡量開發(fā)和使用種肥源。
（2）如果農場計劃使用的投入物質未列入有機生產(chǎn)標準附錄A中，那么申請認證的單位必須向認證機構申報，在認證機構參照標準附錄D的要求對該物質進行評估并同意使用后，農場方可使用該物質。
在土壤培肥中還應注意人糞尿的使用范圍。必須使用時，應當按照相關要求進行腐熟和化處理，并不得與作物食用部分接觸。禁止在葉菜類、塊莖類和塊根類作物上施用。